Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CHCHD7Q9BUK0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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