Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GORASP1Q9BQQ3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms