Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL2Q99962 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL2Q99962 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL2Q99962 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3GL2Q99962 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms