Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms