Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GCNAQ96QF7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GCNAQ96QF7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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