Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C18orf8Q96DM3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms