Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms