Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms