Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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