Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4BQ8N7F7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms