Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP1Q8N474 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFRP1Q8N474 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms