Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNE4Q8N205 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms