Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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