Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms