Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00299Q6ZSB3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms