Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED8Q6PL24 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms