Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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