Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms