Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms