Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms