Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms