Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNOP1Q1ED39 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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