Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GEN1Q17RS7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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