Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPROQ16827 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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