Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EXT1Q16394 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms