Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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