Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCAPHQ15003 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCAPHQ15003 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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