Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKG1Q13976 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKG1Q13976 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms