Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ITGA9Q13797 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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