Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMB3Q13751 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms