Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL1Q13616 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms