Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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