Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK3Q13003 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GRIK3Q13003 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK3Q13003 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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