Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms