Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NPRL3Q12980 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms