Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN1Q12860 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms