Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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