Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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