Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF5Q12774 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms