Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms