Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms