Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms