Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNA1Q09470 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms