Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms