Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms