Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms