Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COG7P83436 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG7P83436 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COG7P83436 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms