Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms