Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVS71-1P61550 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms