Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1P60507 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1P60507 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms